有人说，蘑菇具有酸甜苦辣咸之外的第六种味道——鲜味。因此，当它与别的一起混合烹饪时，是很好的“美味补给”。专家表示，为发挥每种菌类的优势，不妨使用不同烹调。
香菇[香菇，又名花菇、猴头菇、香蕈、香信、香菌、冬菇、香菰，为侧耳科植物香蕈的子实体。]，味道重，比较适合烧、油焖，比如在热油里放入葱姜，翻炒3分钟左右，或者在清蒸鱼[清蒸鱼是用各类鱼制作的一道家常菜，主要原材料有鱼、生姜、香蒜等，口味咸鲜，鱼肉软嫩，鲜香味美，汤清味醇，具有养血和开胃的功效，是舌尖上的美食。]里面配香菇。
草菇主要是爆炒，在爆炒过程中，维生素C等不容易被破坏，而且草菇吃着口感很好，适于做汤或素炒。
金针菇[金针菇学名毛柄金钱菌，又称毛柄小火菇、构菌、朴菇、冬菇、朴菰 、冻菌、金菇、智力菇等，英文为：“Enoki Mushroom”。]味道鲜美，是拌凉菜和火锅配料的上选，但最好煮6分钟以上，否则容易中毒，脾胃虚寒者也不宜吃太多。
口蘑味道较清淡，煲汤最好。
味道甜的茶树菇[柱状田头菇，是一种食药用菌，菌盖细嫩、柄脆、昧纯香、鲜美可口，因野生于油茶树的枯干上也得名茶树菇。]、杏鲍菇[杏鲍菇（Pleurotus eryngii），是一种生长于欧洲地中海区域、中东和北非，但也在亚洲部分地区生长的食用性菇类，因其具有杏仁的香味和菌肉肥厚如鲍鱼的口感而得名。]、袖珍菇等最适合炒制。
猴头菇[猴头菇（学名：Hericium erinaceus；英文名：Lion's Mane Mushroom，Bearded Tooth Mushroom），又叫猴头菌，只因外形酷似猴头而得名。]宜用高温、旺火烧煮。但总的来说，菌类最好还是以清炒或清炖方法为主，才不失蘑菇的原汁**。
与其他食材巧妙搭配，蘑菇还具有不同的疗效。专家介绍说香菇、金针菇、平菇可炖肉[炖肉，风味独特，是广东梅州客家人婚宴喜庆及节日必用的名菜。]或炖鸡吃，能够益气补气，增加抵抗力;做松蘑、猴头菇时，不妨放一点肉烧汤喝，不仅味道鲜美，还能起到抗衰老，延年益寿的作用;金针菇炖鲫鱼可以健脑;竹荪具有防腐功效，炖肉时如果怕吃不完，可以放一点竹荪，放在里不会变坏。
此外，做菜时，尽可能把蘑菇切得小一点，因为它的纤维素不仅不好消化，而且还会影响消化液进入其它食物。但是蘑菇浸出物[浸出物是指除蛋白质、盐类、维生素外能溶于水的浸出性物质，包括含氮浸出物和无氮浸出物。]、游离氨基酸和芳香物质却能增进食欲，促使胃液分泌，从而有利于更好地吸收其它食物。