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1、达到性成熟后种蜈蚣的雌雄个体从外形上区别很小,只有细心反复观察才能作粗略判断。雌性头部扁圆、呈饼状,雄性头部稍隆、椭圆形。雌性躯体较大,躯干部较宽,腹部肥厚;雄性体型小,躯干部窄,腹部紧缩薄瘦等。在临近繁殖时节,雌蜈蚣活动量少,反应迟钝。而雄蜈蚣活动频繁,动作灵活。
2、鉴别蜈蚣性别最直接而又较准确的方法还是翻看其腹面的生殖孔,看有无生殖肢或几丁质化的阴茎,雌蜈蚣无这两个器官,而雄蜈蚣有一对生殖肢或几丁质化的阴茎(多棘蜈蚣除外)。